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C57BL/6N-Tg(1.28HBV)/Vst乙肝病毒轉基因小鼠的轉錄組學分析
新聞來源:CEIDI西遞 發布時間:2024-01-29

摘要:觀察 C57BL/ 6N-Tg (1. 28HBV) / Vst 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)轉基因(HBV-Tg) 小鼠模型的特征,并分析 HBV-Tg 小鼠模型的轉錄組學特點。

目的 觀察 C57BL/ 6N-Tg (1. 28HBV) / Vst 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)轉基因(HBV-Tg) 小鼠模型的特征,并分析 HBV-Tg 小鼠模型的轉錄組學特點。>>>商務洽談,點此處,在線咨詢

方法 以 10 只雄性 HBV-Tg 小鼠為實驗組,10 只野 生型小鼠為對照組。 以血清 HBV DNA、HBsAg、HBeAg 水平和肝組織 HBsAg、HBcAg 表達情況評價模型小鼠病毒學 特征,檢測血清 ALT、AST,肝組織 HE、天狼猩紅染色及肝組織 Hyp 含量評估小鼠肝臟炎癥及纖維化程度。 兩組各 隨機選擇 3 例肝組織樣本提取 RNA 進行高通量轉錄組測序。 經 R 軟件分析獲得表達顯著的差異基因,經 GO 和 KEGG 分析獲得差異基因功能富集情況,再采用實時熒光定量 PCR(RT-qPCR)對差異顯著的基因進行驗證。


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結果 與正常組相比,模型組 ALT、AST 水平均有所升高,以 ALT 更為顯著(P < 0. 05);模型組肝組織 HE 染色可見肝細胞 核增大,個別肝細胞出現腫脹。 天狼猩紅染色結果顯示,HBV 轉基因組匯管區及小葉間出現少量膠原沉積,呈細線 狀。 通過篩選條件( | logFC| > 2 倍且 P.adj < 0. 05)獲得差異基因共計 1352 個,其中上調基因 703 個,下調基因 649 個。 KEGG 分析提示差異基因主要在 PPAR 信號通路、視黃醇代謝、脂肪酸降解等通路中富集(P.adj < 0. 05)。 明 顯上調的差異基因主要有 Cyp4a10、Cyp4a14、Acot1、Acot3、Ehhadh 等,明顯下調基因包括 Scn5a、Apol10b、Igddc4、 Cxcl1、9530077C05Rik 等,經 RT-qPCR 驗證趨勢一致(P < 0. 05)。

結論 HBV-Tg 小鼠具有自發纖維化的趨勢,經 轉錄組學分析,慢性乙型病毒性肝炎(chronic hepatits B, CHB)發生的潛在機制主要涉及 PPAR 信號通路、視黃醇 代謝、脂肪酸降解、藥物代謝等通路。

閱讀原文:C57BL╱6N-Tg(128HBV)╱Vst乙肝病毒轉基因小鼠的轉錄組學分析.pdf

來源:中國實驗動物學報2023年第12期


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